屋顶绿化类型种类多样、层次丰富，因此在绿化植物选择上，应针对不同的屋顶绿化类型，选择适宜的绿化植物。
针对屋顶的特殊生境条件，屋顶绿化植物的选择应以耐旱、耐热、耐寒、耐强光照、抗强风和少病虫害的植物为主，而且生长特性和观赏特性稳定、可粗放管理、滞尘控温能力较强。不同类别的绿化植物根系分布深度大致如下：草坪草约10厘米、草本地被约20～40厘米，小灌木约30～50厘米，大灌木约60～厘米，小乔木约～厘米，大乔木多在厘米以上。
因此，屋顶绿化应尽量采用低矮灌木、草坪、地被植物和攀援植物，原则上不栽植大型乔木，有条件时可少量种植耐旱小乔木。这不仅有利于降低营造和维护成本，也可以适应屋顶土壤基质厚度有限的特点。另外，不宜选用根系穿透性较强的植物，防止植物根系穿透建筑防水层，如竹类植物。
在楼房顶层的绿化中，一般没有休闲功能要求，也不对外开放，宜采用单纯绿化形式，可采用草坪式绿化，以发挥生态功能为主。适宜栽植的植物有佛甲草、垂盆草、凹叶景天、德国景天、大花马齿苋、金叶过路*、画眉草、雀麦、葛藤等植物。
在裙楼、架空层、低层商业和单位楼房楼顶等屋顶绿化中，多将屋顶绿化与休闲、健身乃至商务活动相结合，屋顶绿化多采用景观式或花园式，可选择的绿化植物比较多样。根据屋顶绿化土壤基质厚度，选择不同的植物，合理配置。
一、覆土厚度小于厘米的屋顶植物选择
色叶灌木：红叶石楠、金边*杨、红花檵木、洒金桃叶珊瑚、红枫、金叶小檗、紫叶小檗、欧洲小檗、花叶胡颓子（树叶颜色不同于常规且具有良好观赏价值，叶片从幼叶到衰老，彩色始终存在，四季可观）。
花灌木：月季、铁海棠、茶梅、山茶、紫薇、杜鹃、美国连翘、凤尾兰、棣棠、蜡梅、伞房决明、金雀花、溲疏、红瑞木、大花醉鱼草、牡荆、大花六道木、金银忍冬、地中海荚蒾等（适合于湖滨、溪流、道路两侧和公园布置，及小庭院点缀和盆栽观赏，还常用于切花和制作盆景）。
观果植物：南天竹、火棘、枸杞、番茄等（常用以点缀园林风景，以花后不断成熟的果实弥补观花植物的不足）。
藤本植物：金银花、*馨、迎春、浓香探春、常春藤、花叶蔓长春花、葡萄、络石、紫藤、藤本月季、腺萼南蛇藤、扶芳藤、猕猴桃、布朗忍冬、西番莲、*瓜、丝瓜、茑萝、牵牛花等（藤本植物会将根扎入不太结实的砂浆中，从而破坏房屋的结构）。
常绿植物：罗汉松、五针松、铺地柏、大叶*杨、瓜子*杨、海桐、八角金盘、龟甲冬青、雀梅、蚊母、阔叶十大功劳、湖北十大功劳、无刺枸骨、胡颓子、匍枝亮绿忍冬等（一种全年保持叶片的植物，叶子可以在枝干上存在12个月或更多时间）。
草本花卉：大花萱草、迷迭香、红花酢浆草、美人蕉、天竺葵、金盏菊、旱金莲、千日红、大丽花等（繁殖容易，多数用种子繁殖；管理方便，露地或盆栽的均好管理；培养周期短，多是残本花卉，为一年生或一二年生）。
二、覆土厚度大于厘米的屋顶植物选择
在土层厚度大于厘米的屋顶，可适当选择大灌木和小乔木，但生长高度不宜超过5米，如桂花、日本晚樱、珊瑚、枇杷、红叶李、木槿、杨梅、石楠、木瓜、垂丝海棠等。
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